Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms