Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms