Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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