Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms