Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SsbP32067 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SsbP32067 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SsbP32067 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SsbP32067 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms