Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NapbP28663 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NapbP28663 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NapbP28663 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NapbP28663 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NapbP28663 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NapbP28663 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NapbP28663 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms