Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou2f1P25425 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms