Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RarbP22605 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RarbP22605 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RarbP22605 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RarbP22605 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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