Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VimP20152 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VimP20152 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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