Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P20040 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P20040 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms