Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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