Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PcnaP17918 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PcnaP17918 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PcnaP17918 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PcnaP17918 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PcnaP17918 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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