Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms