Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms