Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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