Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01853 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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