Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp12O08736 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms