Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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