Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf4bG5E8Z2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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