Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm8005F6YKY3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms