Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms