Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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