Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms