Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc146E9Q9F7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms