Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gcom1E9PZ54 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gcom1E9PZ54 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gcom1E9PZ54 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms