Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah3B2RWG3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah3B2RWG3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms