Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms