Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms