Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Uhrf1bp1B2KF50 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms