Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skint4A7TZF3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skint4A7TZF3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms