Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms