Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms