Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RNP2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms