Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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