Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms