Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms