Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Vamp5Q9Z2P8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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