Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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