Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cml5Q9QXS8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms