Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdcQ9QW08 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms