Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms