Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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