Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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SelenofQ9ERR7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms