Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms