Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms