Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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