Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jam3Q9D8B7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms