Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms