Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Cldn23Q9D7D7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms