Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pramef12Q9D2F1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pramef12Q9D2F1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pramef12Q9D2F1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pramef12Q9D2F1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pramef12Q9D2F1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pramef12Q9D2F1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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